P.10. AMPLIFIKASI LINTAS SPESIES MARKA SSR JARAK PAGAR (Jatropha curcas L.) DALAM GENUS: POLIMORFISME ALEL DAN DERAJAT HUBUNGAN

Darmawan Saptadi1, Asep Setiawan2, Bambang Heliyanto3, Sudarsono2
1Jurusan Budidaya Pertanian, Faperta, Universitas Brawijaya, Jl. Veteran, Malang (darmawansaptadi@gmail.com). 2Lab. PMB, Departemen Agronomi dan Hortikultura, Faperta, IPB. Jl. Meranti, Kampus Darmaga, Bogor 16680 (s_sudarsono@ymail.com). 3Balai Penelitian Tanaman Pemanis dan Serat, Jl. Raya Karangploso km. 4, Malang

Abstrak

Marka SSR mempunyai sifat transferable sehingga dapat digunakan untuk mengakses keragaman genetik spesies lain di luar spesies di mana marka tersebut dikembangkan. Di Indonesia ada empat kerabat dekat Jatropha curcas yang potensial untuk dimanfaatkan sebagai sumber keragaman baru melalui persilangan insterspesies. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui kemampuan amplifikasi lintas spesies marka SSR yang telah dikembangkan dari J. curcas kepada spesies kerabatnya (J. integerrima, J. multifida, J. gossypifolia, J. podagrica) dan mengetahui derajat hubungan antara spesies-spesies tersebut.

Dari 28 primer yang digunakan 11 primer dapat diamplifikasi pada semua spesies yang diuji. Pasangan primer EU099519, EU099528 dan EU099525 tidak dapat diamplifikasi kecuali pada J. curcas. Persentase polimorfisme keseluruhan di antara semua spesies yang diuji adalah 95% dengan rerata kesamaan genetik sebesar 0.34. Persentase polimorfisme paling rendah (17.35) dengan kesamaan genetik paling tinggi (0.60) didapatkan antara J. podagrica vs J. multifida. Korelasi antara persentase polimorfisme dengan kesamaan genetik cukup baik yaitu bernilai 0.75. Analisis dendrogram menunjukkan bahwa jarak paling jauh ditemukan antara J. curcas dengan J. gossypifolia dan jarak paling dekat ditemukan antara J. podagrica dan J. multifida. Marka yang digunakan dapat diandalkan untuk membedakan antar spesies dan dapat digunakan untuk identifikasi hasil persilangan interspesifik secara molekuler.

Kata kunci :   Spesies kerabat, J. integerrima Jacq., jarak genetik

Mini poster darmawan saptadi - marker SSR jarak pagar

Mini poster – Darmawan Saptadi
Marker SSR untuk Analisis Genetik Jarak Pagar

Advertisements

About PMB Lab: Prof. Sudarsono

This blog is dedicated as a communication media among alumni associated with PMB Lab, Dept. of Agronomy and Horticulture, Fac. of Agriculture, IPB, Bogor – Indonesia. It contains various information related to alumni activities, PMB Lab’s on going activities and other related matters.
This entry was posted in Mini Poster and tagged , , , , . Bookmark the permalink.

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out /  Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out /  Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out /  Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out /  Change )

w

Connecting to %s